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Rubicon Genomics R400682 SMARTer ThruPLEX Plasma-Seq Kit

SMARTer® ThruPLEX® Plasma-Seq Kit

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  • R400682

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  • 注册品牌: Takara
  • 生产厂家: Rubicon
  • 订购货号: R400682
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  • 规格型号: 480Rxns
  • 产品编号: HY-12983
  • 产品种类: 文库构建

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SMARTer® ThruPLEX® Plasma-Seq Kit:cfDNA

Rubicon SMARTer ThruPLEX Plasma-Seq Kit

Code No.                            产品名称
R400679   SMARTer® ThruPLEX® Plasma-Seq Kit
R400680   SMARTer® ThruPLEX® Plasma-Seq Kit
R400681   SMARTer® ThruPLEX® Plasma-Seq Kit
R400682   SMARTer® ThruPLEX® Plasma-Seq Kit

降解
• 包含单体,二聚体,三聚体的核小体DNA
• 成分和产量高度可变(病人和疾病相关)
• 小分子,分子大小(170 bp )

高品质的游离DNA (cell free DNA) NGS文库构建
SMARTer® ThruPLEX® Plasma-Seq Kit
· 专为cfDNA设计:经过优化的修复及连接试剂
· 高品质NGS文库:高的文库多样性,在宽广的GC含量范围内,可以达到高检测再现性
· 起始量范围广:<1 ng到30 ng cfDNA量
· 快速简便:1个反应管、2小时、3步反应的简单操作,无需纯化或样品转移步骤
· 应用领域:液态活检、ctDNA、目标区域测序等领域文库构建
· 兼容自动化平台:Beckman FXP Workstation

■ 产品说明:
SMARTer ThruPLEX Plasma-seq Kit基于ThruPLEX技术,并用于血浆来源cfDNA高品质NGS文库构建。该试剂已针对cfDNA 进行了专门优化,在保持样本GC代表性的基础上,尽可能的提升了文库的复杂度。文库可用于CNV分析、全基因组测序分析或是采用一些panel针对目标区域进行捕获富集后的DNA分析,如Agilent SureSelect and Roche NimbleGen SeqCap EZ。
SMARTer ThruPLEX Plasma-Seq Kit不包含index。兼容的SMARTer Index如下所述,需要单独购买。
使用SMARTer ThruPLEX Plasma-Seq试剂盒制备的文库,提供了更高的灵敏度,可以更好地了解血浆样本中基因变异结果。与其它液态活检的样品一样,血浆由于其易获得、价值高的特点,在某些研究领域,如对肿瘤学的转化研究或者对孕妇血浆中胎儿游离DNA 的发育学研究,深受科研工作者的重视。

兼容主要靶标富集平台:Agilent SureSelect®, Roche Nimblegen® SeqCap® EZ, 和 IDT xGen® Lockdown® probes

兼容Beckman Biomek FXP :需要与Beckman联络获得流程和scripts

Rubicon SMARTer ThruPLEX Plasma-Seq Kit

主要应用

全基因组测序,外显子测序,靶向测序

Takara&Clontech NGS系列制品,SMARTer® ThruPLEX® Plasma-Seq:cfDNA分析

SMARTer DNA HT dual index kits
SMARTer DNA HT dual index kits是与SMARTer ThruPLEX或SMARTer PicoPLEX文库制备试剂盒搭配使用,用以构建Illumina测序文库的index引物试剂盒。这些试剂盒包含Illumina Nextera® XT v2 index序列对应的index引物,最多可提供384种不同的双端index,用于样本混合测序时的区分。其中index引物预先分装在4个不同条形码标记的index微孔板中,每个微孔板可提供不同的96种index组合(Code No.R400660-R400663),index微孔板(96N Sets A-D)的每个孔提供的量足够进行一次测序反应;另一种是一套中有24个单独的反应管,每个反应管中包含不同的双端index组合(Code No.R400664),且每个反应管(24N)提供的量足够进行两次测序反应。

SMARTer DNA unique dual index kits
SMARTer DNA unique dual index kits是与SMARTer ThruPLEX或SMARTer PicoPLEX文库制备试剂盒搭配使用,用以构建Illumina测序文库的index引物试剂盒。这些试剂盒包含“IDT for Illumina UD”对应的index引物,最多可提供96种不同双端index,用于样本混合测序时的区分。index引物预先分装在不同的4组各24个单独的管中,其中每组可提供24种不同index引物组合(Code No.R400665-R400668)。每个index引物管(24U Sets A-D)提供的量足够进行两次测序反应。

SMARTer DNA single index kits
SMARTer DNA single index kits是与SMARTer ThruPLEX或SMARTer PicoPLEX文库制备试剂盒搭配使用,用以构建Illumina测序文库的index引物试剂盒。这些试剂盒包含与“TruSeq LT set A”序列对应的index引物,可提供24种单端index,用于样本混合测序时的区分。index引物预先分装在不同的2组各12个单独的管中,其中每组可提供12种不同index引物组合(Code No.R400695和R400697)。每个index引物管(12U Sets A-B)提供的量足够进行8次测序反应。

 

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ThruPLEX Plasma-seq Kit
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