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蛋白样品制备详解—杂质去除篇

蛋白样品制备中,在细胞破碎之后,既可以利用特定蛋白质的特性来分离某一类蛋白质,比如亲和纯化,比如前面介绍的磷酸化蛋白富集,或者膜蛋白富集;另外一个考虑方向是去除杂质—-去掉样品中某些非目标高丰度蛋白或者杂质的干扰,同样可以达到简化样本的目的。当然要小心“倒洗脚水的时候别把婴儿也倒掉了”,一定要选择可靠的产品。

比如,潜在疾病标志物的最好样本来源就是血清或其他体液,此类样本可以提供人蛋白质组中绝大部分组份。然而用蛋白质组分析方法鉴定疾病标志物最大的挑战来自于血清中大量的高丰度蛋白对检测的干扰,血清中有大约55%的蛋白为白蛋白,而IgG大约占血清中蛋白总量的10-25%,这些高丰度蛋白的存在会增加低丰度蛋白  检测的难度,去除占血清总蛋白近75%的白蛋白和IgG将有助于更好地鉴定其他的蛋白。G-Biosciences的AlbuminOUT™白蛋白去除试剂盒堪称白蛋白去除神器。血浆和脑脊髓液等样本中,包含大量的白蛋白,从而封闭掉在二维凝胶电泳中发现和鉴定其他低丰度蛋白的可能。AlbuminOUT™白蛋白去除试剂盒被设计用来在这种样本中大量去除白蛋白。

这种白蛋白去除方法是基于白蛋白和Cibachron蓝色染料的结合。AlbuminOUT™被优化从样本中去除人的白蛋白。AlbuminOUT™使用快速离心柱方法,每个柱子含有0.2ml的染料结合树脂,从而可以结合大于2mg的人白蛋白。AlbuminOUT™可以从5-50微升人血浆中去除大于98%的白蛋白。

离心柱形式可以在10分钟内去除白蛋白。高结合力的蓝色染料结合树脂可以从人,猪,羊,狗,兔,大鼠和牛样本中达到瞬间的结合和去除白蛋白。AlbuminOUT™或许也可以从其他物种中去除白蛋白。适用于处理25或50个样本

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Figure 1:  2D  analysis  of  whole  human  serum  before  (left)  and  after (right) treatment with AlbminOUT.

 

产品特点:

从样本中不到10分钟的时间内去除白蛋白

基于白蛋白和Cibachron蓝色染料的结合

每个柱子的结合力大于2mg的人白蛋白

从5-50微升人血浆中去除大于98%的白蛋白

 

去垢剂如SDS、Tween、Tritonde等是蛋白样品处理过程中常用的组分。去污剂在蛋白提取和样本制备过程中是很重要的物质,特别是研究疏水蛋白时。蛋白样本中高浓度去污剂的存在能够影响ELISA,IEF和蛋白的蛋白酶消化,以及用质谱进行分析时抑制肽的离子化。

所谓请神容易送神难。要除掉这些去垢剂?G-Biosciences推出的DetergentOUT™ GB-S10去污剂去除柱子和树脂专门设计用来除于蛋白或其他生物样本中所含有的去污剂,树脂能够从蛋白水溶液和肽样本中去除自由的,未结合的阴离子的,非离子或两性离子的去污剂(e.g. SDS, Triton® X-100 或CHAPS),同时对于下游进行的质谱或其他技术的分析应用带来最小的样本丢失。

DetergentOUT™ GB-S10柱子在第三方的研究使用中表明完全兼容DI-QTOF和 LC-MS/MS(请见参考文献)。DetergentOUT™ GB-S10柱子的使用显著增加到了检测到的肽光谱的数量。除此之外,DetergentOUT™ GB-S10柱子对于去污剂有高度的结合容量,比如每毫升固定的树脂可以结合6mg SDS和14mg Triton® X-100。

常见去污剂的选择:

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Table 1:  A comparison of the detergent removal rates and percentage protein recovery with DetergentOUT™ GBS10.

 

 

 

华雅思创生物—G-Biosciences全国授权代理

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