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产品编号:HY-12966

Rubicon Genomics R400586 ThruPLEX Tag-seq 96D Kit

ThruPLEX Tag-seq 96D Kit

  • 注册品牌: Takara
  • 生产厂家: Rubicon
  • 订购货号: R400586
  • 保存温度: -20℃
  • 规格型号: 96Rxns
  • 产品编号: HY-12966
  • 产品种类: 文库构建

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品牌                            货号                    名称                                      规格

Rubicon Genomics R400584 ThruPLEX Tag-seq 6S(12)Kit  12Rxns

Rubicon Genomics R400585 ThruPLEX Tag-seq 48S Kit           48Rxns

Rubicon Genomics R400586 ThruPLEX Tag-seq 96D Kit           96Rxns

 

构建带有UMT(Unique Molecular Tags)的Illumina NGS文库

ThruPLEX® Tag-seq Kit

  • 可信赖的实验结果。ThruPLEX Tag-seq 技术提供了多达1,600万个分子标签来纠正测序误差,

   提供可信的变异检测分析。

  • 发现更多,成本更低。结合基于杂交技术的目标序列富集系统可分析数百个基因,同时分析突变和

   结构变异。

  • 每次都可获得高质量文库。单管操作,2小时,3步操作流程。使用简便,可减少使用者操作误差和

   污染发生。

  • 省时的生物信息学分析方案。采用Curio Genomics提供的云服务软件或开源软件可以快速获得

   研究结果。

  • 珍贵样品分析成为可能。更低的DNA起始量,以往由于起始量太低而不能分析的样品也可以分析了。

   ThruPLEX Tag-seq可以1 ng至50 ng cfDNA或片段化的dsDNA起始,兼容多种样品类型。

 

■ 产品说明:

ThruPLEX Tag-seq采用带有特别分子标签(UMT)的ThruPLEX引物构建带有分子标记和样品检索引物的Illumina NGS文库。每个试剂盒包含超过1,600万个特别序列用于在扩增前标记每条DNA片段,可以在文库制备、目标富集和数据分析过程中追踪DNA片段,以检测低丰度等位基因或计数独立片段。采用ThruPLEX 技术设计及优化,可以1到50 ng DNA起始构建高多样性、高重复性文库。整个流程在单管或单孔中就可完成,只需3步,2小时,无需中间纯化步骤和样品转移,避免了操作误差和样品损失。ThruPLEX Tag-seq Kit 包含所需全部试剂,包括可以多重标记96个样品的检索引物。纯化和定量后,文库可以采用标准Illumina测序试剂和流程在Illumina NGS平台进行测序。

图1. 单管,三步操作流程。 ThruPLEX Tag-seq Kit以1-50 ng DNA起始构建检索引物文库只需3步:末端修复,接头连接和高保真文库扩增。无需纯化和样品转移步骤。简化的工作流程,在单管或单孔中2个小时即可完成,避免样品损失,增强了阳性识别。

 

图2. ThruPLEX DNA-seq Kit技术概要。ThruPLEX技术以片段化双链DNA或游离DNA起始,只需3步反应,简单高效。

图3. 减少背景,结果更可靠。以30 ng 1% Horizon cfDNA standard,采用 ThruPLEX Tag-seq构建文库。Agilent SureSelect富集目标区域,~5,000X覆盖度测序,采用Curio Genomics生物信息学平台分析数据。采用原始数据分析,EGFR 的突变(黄色点)会被背景误差遮盖(左图)。而在数据分析过程中使用UMT修正误差,突变更容易识别(右图)。

 

图4. 显著提高信噪比,发现更多。以30 ng(A)或10 ng Horizon cfDNA standard采用ThruPLEX Tag-seq构建文库,240 KB定制panel(NimbleGen SeqCapEZ)富集目标区域,HiSeq 2500 ~5,000X覆盖度测序。Curio Genomics生物信息学分析平台进行数据分析。

*数据来源于Takara Bio Inc.

 

■ 产品组成

  • Template Preparation Buffer (Red)模板准备缓冲液(红色)
  • Template Preparation Enzyme (Red)模板准备酶(红色)
  • Library Synthesis Buffer (Yellow)文库合成缓冲液(黄色)
  • Library Synthesis Enzyme (Yellow)文库合成酶(黄色)
  • Library Amplification Buffer(Green)文库扩增缓冲液(绿色)
  • Library Amplification Enzyme(Green)文库扩增酶(绿色)
  • Nuclease-Free Water(Clear)无核酸酶水
  • Indexing Reagent试剂(蓝色)

 

自备试剂:

热循环仪(推荐使用实时仪器)

离心分离机

PCR管或96孔PCR板和密封件

低吸附滤芯枪头

新鲜制备的80%(v / v)乙醇

Agencourt®XP核酸纯化磁珠(Beckman Coulter,目录号A63880)

 

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